Il Consiglio di Amministrazione della Fondazione è composto da 7 membri 5 dei quali nominati dal Comune di Morbegno e 2 dalla Comunità Montana Valtellina di Morbegno in rappresentanza dei restanti 24 Comuni del territorio mandamentale.

Il Consiglio di Amministrazione dura in carica 5 anni e nella seduta di primo insediamento nomina il Presidente ed il Vice Presidente.

Il Consiglio di Amministrazione, organo di indirizzo e di controllo, determina l’indirizzo strategico della Fondazione; definisce i programmi da attuare e gli obiettivi da raggiungere; verifica i risultati conseguiti; emana le direttive di carattere generale, adottando tutti i provvedimenti di sua competenza. (Art. 11 Statuto).

L'attuale Consiglio di Amministrazione è composto come segue:

• Campanella Emilio (Presidente)
• Ferrè Matteo (Vice-Presidente)
• Marchini Roberto (Consigliere)
• Pedroli Giulia (Consigliere)
• Salvadori Ambrogio (Consigliere)
• Scinetti Fabrizio (Consigliere)
• Venosta Antonio (Consigliere)